怀安自闽县析出到最后并入侯官县，共历时598年。

宋太平兴国六年（981年），福州郡守何允昭奏“闽县画疆，不啻百里，户逾二万，吏思簿籍，繁征输远”，乃析闽县9乡置怀安县。此时，闽县、侯官、怀安三县皆隶于福州威武军。今上渡三县洲即为当时三县所属闽江河道冲积洲。怀安县治初设在芋原江北30里的荆溪镇桐口村。

　　宋咸平二年（999年），福州转运使丁谓奏移怀安县治于城西北25里的南台岛北端怀安村，改“闽越亭”为县衙署。这里山峦秀拔，有巨石冠山巅，高大坦平，名为石岊。昔日洪山桥未建，怀安就已砌筑一座横跨洪江的大桥，至今江边还有“大桥头”的地名，足见当年渡口繁华的景象。南宋理学家朱熹有《晚发怀安》诗云：“挂帆望烟渚，整衣棹别津。风水云已便，我行安得停。”据《闽书》引旧志云：“石岁觉增长，后因火不长”等奇迹，是早期海岸线上升的记载。元至元二十二年（1285年）怀安县治一度移到县治西，不久又迁回原址；因元时怀安常被闽江水患所冲刷，土崩地陷，在元至大年间（1308－1311年）再度移到城西澄澜阁旧址，即今渡鸡口一带。明洪武二年（1369年）闽县县治迁至府治东南秀实坊内的净业寺故址，即今鼓楼区旗汛口，俗称“旧闽县”。三年，侯官重建官贤坊衙署。十二年，怀安县治移于古罗城永安门外，今福州鼓楼区三角井一带。到明万历八年（1580年）怀安县又并入侯官县，其县治废。怀安自闽县析出到最后并入侯官县，共历时598年。
洪武十二年(1369年)怀安县署从石岊(今郊区建新乡淮安村)移到城北永安门外。知县蓝武在北街营房建县署(万历间废怀安，改县署为关帝庙)。一时附郭并设3县署，

　万历八年(1580年)
　　怀安县并入侯官县，境内成为闽县、侯官分治局面。
旧怀安县
　　国朝养济院右二坊太平桥边，洪武间置。今县并侯官，而院未废。
　　城北丛冢府城北门外太平里旧闽山院废地也。县旧有义冢，在太平山，宋绍兴间，郡令芙蓉寺僧营建，男左女右，各四穴，广二丈二尺，深二丈，以待不能葬者。乾道六年，监簿黄启宗又为三坟于其东。永乐中，圯于洪水。成化十七年，知府唐珣更建今所。